В архивном фонде Вологодской духовной консистории в клировой ведомости Троицкой Двиницкой церкви Двиницкой волости Кадниковского уезда в сведениях о церковном старосте, приходском попечительстве и наставниках приходского училища или школы за 1889 год было указано, что школа была открыта в 1887 году и находилась при Троицкой Двиницкой церкви в селе Чекшино.
В 1935 году на базе начальной школы открылась Двиницкая семилетняя школа. Двухэтажное здание школы располагалось по улице Ветеранов. До настоящего времени не сохранилось.
1 сентября 1975 года новая школа распахнула свои двери перед учениками и учителями. Действующее здание школы построил на свои средства совхоз "Союз", директором которого в то время был Гаганов Р.И. Действующее здание школы расположено по адресу ул. Молодежная, д. 11, д. Чекшино.